Poboljšanje položaja marginaliziranih grupa je nemoguće postići bez odgovarajuće saradnje s institucijama vlasti, posebno onim čiji je mandat da brinu o položaju ovih grupa. Uzimajući u obzir tu činjenicu Program podrške marginalizovanim grupama (PPMG) predvidio je da se i institucijama sistema osiguraju dodatni treninzi o temama za koje su najviše zainteresirani, pri čemu je poseban naglasak na pitanjima  iz oblasti organizacijskog menadžmenta i internih kontrola. Treninzi će trajati tri dana, održavat će se na participativnoj osnovi, a vodit će ih renomirani konsultanti iz Bosne i Hercegovine.

Predviđeno je također da na ovim trenizima učestvuju i organizacije građanskog društva koje se bave zajedničkim temama što bi omogućilo međusobnu razmjenu iskustava i znanja te ojačalo njihovu saradnju. Treninzi će svakako poslužiti i da institucije vlasti prepoznaju značajne organizacije koje mogu znatno doprinijeti rješavanju pitanja iz oblasti u kojima djeluju.